Une entrée rue Vivienne a été créée sur le jardin éponyme. "Elle permet de renouveler le regard sur ce site patrimonial", estime Bruno Gaudier. Un vaste hall traversant et lumineux accueille ici les visiteurs. Une mezzanine a été démolie pour offrir une plus grande hauteur sous plafond. Trois façades autrefois "à l'arrière", deviennent ainsi des façades d'entrée sur les halls Vivienne et Roux-Spitz. "Entre cour et jardin, le hall traversant symbolise ce lien entre le monde des chercheurs et les nouveaux publics", considère Bruno Gaudier. Un nouvel escalier d'honneur, monumental, occupe le centre de la pièce. La structure de maçonnerie sous l'escalier existant a été supprimée. En effet, "un escalier existant de 25 mètres de long a été déplacé", révèle Virginie Brégal. Le volume de pierre ancien, en triple arcature, est conservé et l'escalier, en acier et aluminium massif, semble suspendu. Il relie désormais des passerelles et laisse entrer la lumière. Au premier étage se trouve le musée, appelé la galerie de verre.