La Fondation Al-Thani prend quant à elle ses quartiers dans l'ancien centre de commandement des navires et sous-marins. Là encore, la succession des pièces et des galeries témoigne de l'inestimable travail artisanal qui a été apporté à ces murs qui ont connu l'Ancien Régime, la Révolution, les Empires et les Républiques. "Ce fut un chantier où seule la main avait sa place. Tout a été fait à la main", insiste Christophe Bottineau, "de la passementerie aux gravures en passant par les dorures". Un savoir-faire unique et irremplaçable que l'on peut admirer dans les quelque 900 mètres carrés de l'appartement de l'intendant, dans les salons comme dans les chambres à coucher. Les collections privées de la Fondation s'étendront sur 400 m², en lieu et place des anciennes galeries de tapisseries.